Carles Puyol vietti koko ammattilaisuransa Barcelonassa, mikä erottaa hänet monista muista La Masian kasvateista ja seuralegendoista.
Puyol liittyi Barcelonan nuorisojärjestelmään vuonna 1995 ja nousi myöhemmin seuran B-joukkueen kautta edustusjoukkueeseen.
Vuonna 1999 alkanut ammattilaisura jatkui aina vuoteen 2014 asti. Puyol ei pelannut tuona aikana yhdessäkään toisessa seurassa.
Moni muu pelaaja pelaaja, kuten Lionel Messi ja Andres Iniesta nousivat niin ikään Barcan edustukseen La Masiasta, mutta eivät pysyneet yhtä seurauskollisina kuin Puyol.
Barcelona-ikoni ehti pelata seuran paidassa 593 kilpailullista ottelua ja voitti muun muassa kolme Mestarien liigaa sekä kuusi La Liigan mestaruutta.
Keskuspuolustajan tontilla viihtynyt Puyolin nousi pelipaikkansa eliittiin ja toimi Barcelonan kapteenina kymmenen vuoden ajan.
Harvinainen seurauskollisuus ja periksiantamaton luonne tekivät hänestä yhden Barcelonan rakastetuimmista pelaajista.